保险公司通常是不可以理赔先天性疾病的。对于先天性疾病、遗传性疾病等,保险公司一般都会在保险产品的免责条款里面说明不予理赔。而且对于患有先天性疾病的人群来说,在投保需要进行健康告知的保险时也会有一定的限制,尤其是成年人,通常还需要进行人工核保,不过如果还只是小孩子的话,则保险公司也可能会做出除外或者延期承保的决定。