单位职工是必须参加职工社保，灵活就业人员则是遵循自愿的原则，可参加可不参加。
除此之外，二者在缴费基数以及缴费比例上也有一定的差别。单位职工参保依据本人上一年度的月平均工资而定，灵活就业人员则根据自己的意愿自由选择社保的缴费基数。
另外，单位灵活就业人员参保缴纳的保险费要高上不少，以养老保险为例，灵活就业人员参保需要按比例缴纳20%的保险费用，而职工参保个人只需要按比例缴纳8%的保险费用，医疗保险方面：在职人员只需要缴纳2%，如果是生孩子费用也可以报销；而灵活就业人员职工医保需要缴纳9%或其他比例，灵活就业人员职工医保是否能够保险生育费用要看地区，比如广州可以，长沙就不可以。
